Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux1P53564 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cux1P53564 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Cux1P53564 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux1P53564 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux1P53564 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux1P53564 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cux1P53564 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cux1P53564 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms