Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fgd1P52734 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fgd1P52734 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms