Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2e3P52483 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2e3P52483 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms