Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Apobec1P51908 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Apobec1P51908 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms