Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccr4P51680 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms