Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CntfP51642 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfP51642 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfP51642 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfP51642 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfP51642 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfP51642 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfP51642 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfP51642 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CntfP51642 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CntfP51642 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CntfP51642 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CntfP51642 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CntfP51642 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms