Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa8P50706 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa8P50706 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms