Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SftpdP50404 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms