Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcl5P50228 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cxcl5P50228 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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