Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hoxc13P50207 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxc13P50207 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms