Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcls1P49710 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcls1P49710 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms