Protein–RNA interactions for Protein: P49452

Cenpc, Centromere protein C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpcP49452 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CenpcP49452 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CenpcP49452 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpcP49452 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpcP49452 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpcP49452 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpcP49452 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpcP49452 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpcP49452 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpcP49452 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CenpcP49452 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms