Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CitP49025 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CitP49025 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CitP49025 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CitP49025 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CitP49025 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CitP49025 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CitP49025 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CitP49025 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CitP49025 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CitP49025 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CitP49025 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CitP49025 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CitP49025 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CitP49025 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CitP49025 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CitP49025 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CitP49025 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CitP49025 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CitP49025 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CitP49025 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CitP49025 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CitP49025 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CitP49025 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CitP49025 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CitP49025 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CitP49025 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CitP49025 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms