Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3P48787 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3P48787 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms