Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Abcd1P48410 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Abcd1P48410 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms