Protein–RNA interactions for Protein: P47964

Rpl36, 60S ribosomal protein L36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl36P47964 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl36P47964 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms