Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capza1P47753 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Capza1P47753 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capza1P47753 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Capza1P47753 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capza1P47753 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Capza1P47753 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Capza1P47753 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Capza1P47753 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms