Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cdkn1bP46414 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms