Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf1P46099 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klf1P46099 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klf1P46099 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms