Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlx1P43345 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlx1P43345 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms