Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NodalP43021 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NodalP43021 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NodalP43021 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NodalP43021 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NodalP43021 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NodalP43021 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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