Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd1P40201 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd1P40201 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Chd1P40201 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Chd1P40201 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd1P40201 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd1P40201 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Chd1P40201 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd1P40201 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd1P40201 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd1P40201 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms