Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Traf2P39429 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Traf2P39429 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Traf2P39429 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms