Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Grik2P39087 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Grik2P39087 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik2P39087 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms