Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col18a1P39061 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col18a1P39061 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms