Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TtlP38585 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TtlP38585 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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TtlP38585 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TtlP38585 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TtlP38585 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TtlP38585 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TtlP38585 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TtlP38585 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TtlP38585 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TtlP38585 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TtlP38585 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TtlP38585 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms