Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Acvr1P37172 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acvr1P37172 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms