Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ercc5P35689 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ercc5P35689 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms