Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ly6fP35460 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ly6fP35460 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms