Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ly6dP35459 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ly6dP35459 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms