Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin1P35438 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Grin1P35438 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms