Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Grin2aP35436 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Grin2aP35436 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms