Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpoP35419 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpoP35419 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TpoP35419 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TpoP35419 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TpoP35419 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TpoP35419 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TpoP35419 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TpoP35419 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TpoP35419 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms