Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PpardP35396 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PpardP35396 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PpardP35396 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PpardP35396 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PpardP35396 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PpardP35396 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PpardP35396 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms