Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab20P35295 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms