Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mmp12P34960 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp12P34960 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms