Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pola1P33609 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pola1P33609 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pola1P33609 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms