Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc11P31313 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc11P31313 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms