Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnd1P30999 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms