Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk4P30285 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk4P30285 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk4P30285 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk4P30285 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk4P30285 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk4P30285 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk4P30285 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk4P30285 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdk4P30285 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms