Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HexaP29416 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HexaP29416 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HexaP29416 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HexaP29416 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HexaP29416 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HexaP29416 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HexaP29416 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HexaP29416 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HexaP29416 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HexaP29416 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HexaP29416 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HexaP29416 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HexaP29416 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HexaP29416 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms