Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcdP28867 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms