Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxraP28700 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxraP28700 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxraP28700 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RxraP28700 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RxraP28700 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RxraP28700 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RxraP28700 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RxraP28700 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RxraP28700 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RxraP28700 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RxraP28700 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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