Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Celf1P28659 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Celf1P28659 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Celf1P28659 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Celf1P28659 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Celf1P28659 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Celf1P28659 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Celf1P28659 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms