Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxd10P28359 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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