Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apex1P28352 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apex1P28352 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apex1P28352 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms