Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Etv4P28322 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Etv4P28322 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms