Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms