Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-DMaP28078 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
H2-DMaP28078 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms