Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2afxP27661 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2afxP27661 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms